(一)办公室。负责机关日常运转工作，承担综合材料、公文处理、财务、会务、机要保密、档案、信息宣传、信访、政务公开、单位的干部人事管理、机构编制、劳动工资等工作。

(二)财经科。负责组织审计市级预算执行情况、决算草案和其他财政收支情况；审计市级财政组织预算执行情况、市级国库办理市级预算资金的收纳拨付情况；审计有关财政转移支付资金。

(三)行政事业审计科。负责部分市直行政事业单位（含所属事业单位）的审计工作。

(四)农业与资源环保审计科。负责农业农村、水利、扶贫开发、自然资源、生态环境、医疗保障、卫生健康、市管医院等部门（含所属事业单位）的审计工作。

(五)计算机审计信息中心。负责在线实时联网审计监督和大数据审计工作，督促、指导全市在线实时联网审计监督和大数据审计工作的开展。

(六)经济责任审计事务中心。负责研究拟定全市经济责任审计的有关规定、办法；负责对全市经济责任审计工作进行指导检查；组织实施市管领导干部及依法属于市审计局审计监督对象的其他领导人员经济责任审计工作；承担市经济责任审计工作领导小组办公室日常工作。

(七)政府投资建设项目审计中心。负责审计市重点建设项目预算执行情况和决算，负责审计城乡基础设施建设项目预算执行情况和决算，对市政府投资的建设项目预算执行情况和决算进行审计监督；负责市直行政、事业单位财政拨款或本单位投资的建设项目的预算和决算审计。

（八）中心审计所。负责全市各乡镇街道财政决算审计，负责市直部门和乡镇街道有关单位财政财务收支审计。